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    上線啦!深圳國家基因庫發布『動植物資源活體庫』門戶

    財訊網 | 2021-05-28 10:36:00

    頭一次聽說深圳國家基因庫(簡稱“國庫”)的“活體庫”時,不少小伙伴自動腦補出一個動、植物的“伊甸園”——想必生活著各種活蹦亂跳的飛禽走獸和生機盎然的花木果草。

    其實呀,它的真面目是這樣的:

    上圖:深圳國家基因庫動植物資源活體庫(簡稱“活體庫”)局部

    看這森嚴的氣象、這靜穆的氛圍、這冷峻的金屬風,你是不是有很多問號?

    那就要說回“活體”這個概念了。廣義的“活體”,通常指有生命的生物體。而在國庫,“活體”則特有所指——攜帶有遺傳信息、能用于衍生出下一代的生物可繁殖體。換句話說,就是“生命種子”。比如動物細胞、植物種子、微生物菌株,都屬于活體范疇。

    為什么要保藏生物活體?

    與其他生物樣本相比,活體樣本不僅攜帶有物種完整的遺傳物質(DNA、RNA),而且由于具有生命活,是許多生命科學研究的重要遺傳材料,能幫助我們更好地理解生物體生長發育、衰老以及疾病發生機制等重大生命科學議題。

    此外,活體資源在減緩物種滅絕、生物育種等方面發揮著舉足輕重的作用。將它們保藏在適宜條件下,需要時進行復蘇培養,可用以恢復物種種群或者改善物種狀。

    同時,活體樣本還是多種生物醫學制品生產的基質材料。比如,工程細胞系可用來生產抗體、基因重組蛋白藥物、人及獸用疫苗等;工程菌可用來發酵,產生重要的生物活物質,應用于臨床醫學和農業等多個領域。

    線下→線上,活體庫門戶營業啦!

    國庫的活體庫,全稱是“動植物資源活體庫”,堪稱一座“生命種子”的寶庫。它借助先進的生物技術,分離、檢測和保存活體資源,開展資源數字化,同時對外共享活體樣本和組學數據,支撐生物多樣研究機構開展生命科學研究。

    同時,活體庫還建立了三大技術體系,包括動物細胞分離、體外培養、細胞檢測和超低溫存儲的技術體系,植物物種采集、保藏和鑒定的技術體系,微生物菌株篩選、鑒定和保藏的技術體系,以此為基礎,可以提供多種個化的技術服務。

    說大事兒:現在,活體庫又多了一種打開方式——“動植物資源活體庫”門戶在國家基因庫生命大數據臺(CNGBdb)正式上線!

    上圖:深圳國家基因庫動植物資源活體庫門戶首頁

      1. 動植物、微生物,豐富資源一覽無余

    動物:38種動物1000份細胞系,包括永生化B淋巴細胞、成纖維細胞、間充質干細胞和腎上皮細胞等。

    植物:數百種植物的種子、憑證標本和分子材料,其中種子資源所涵蓋的物種類型豐富多樣,包括農作物、經濟作物、野生植物等多種具有重要科研和經濟價值的植物物種。

    微生物:2000余株人體共生、豬腸道、環境來源的菌株,以及具備高GC或低GC基因組、耐高溫、質控等特點的特色菌株。其中包含1500余株人體腸道細菌,涉及200個細菌種。

    2. 檢索、篩選、申請,便捷易用

    動植物資源活體庫門戶提供中、英文雙語界面,操作便捷、直觀:

    檢索樣本:在搜索框中輸入物種拉丁名、俗名或樣本編號,即可查看相關活體樣本的詳細信息;

    篩選樣本:點擊導航欄“動物”/“植物”/“微生物”,分類別查看整體資源情況,或縮小范圍再檢索;

    技術服務:點擊導航欄“技術服務”,即可查看活體庫對外提供的各類技術服務;

    申請樣本/服務:點擊右下角“聯系我們”,填寫您的資源使用申請或技術服務需求,國庫將盡快與您取得聯系。

    3. 資源詳情全面展示

    活體樣本的詳情頁面全面展示了樣本的各類信息,以便用戶判斷該樣本能否滿足自身的需求。以小麂耳朵皮膚成纖維細胞(編號:CNGB0007)為例,頁面上不僅展示了樣本的基本信息、培養特、檢測結果,還包含顯微照片、相關研究成果文獻,甚至能直接訪問CNGBdb所關聯的基因組數據。

    動植物資源活體庫線上門戶的發布,將大大提升用戶共享活體資源、獲取臺技術服務的便利,使國家基因庫的開放共享更進一步。

    共享資源、設施,助推科研突破

    自2019年以來,活體庫為中國科學院深圳先進技術研究院、華中科技大學、復旦大學、廣東省農業科學院、山東大學、北京協和醫院、上海仁濟醫院等20余家科研院所、醫療機構等提供4000余份活體資源,包括動物成纖維細胞、植物種子和菌株資源,支撐多項重大科研項目開展。

    同時,活體庫還參與了國庫與深圳華大生命科學研究院、荷蘭遺傳資源中心合作開展的生菜群體測序項目,搜集了3000余份生菜種質資源,打造了全世界最齊全的生菜資源庫及遺傳信息庫。項目一期對來自全球47個國家的445份生菜種質資源展開全基因組重測序工作,全面揭示了栽培生菜的完整馴化進程。項目成果于2021年4月12日發表于《Nature Genetics》。

    此前,活體庫還支撐了人體腸道細菌基因組集(Culturable Genome Reference, CGR)建立項目,采用人體腸道高通量培養組學技術,篩選、保藏了2萬余株人體腸道細菌菌株資源,覆蓋200余個細菌種屬,并獲得了1520個細菌基因組序列。這是目前全球最大的人體腸道細菌基因組集,相關成果2019年2月發表于《Nature Biotechnology》。

    活體庫立足于國庫強大的生物樣本及信息存儲能力、基因組信息解讀能力以及基因組合成與編輯的能力,致力于建設數字化的生物多樣基地和生物資源庫,以期促進生物物種多樣的保護和生物遺傳資源的開發利用。通過分發共享高質量的生物資源、提供優質全面的技術服務,以更好地服務于現代科研和相關產業發展。

    上圖:活體庫工作場景

    國庫期待與更多科研機構、產業單位通力合作,踐行國家賦予國庫的使命,以領先的設施臺和技術實力,為行業注入核心力量,助力提高科研效率、促進行業繁榮、建立開放穩健的行業生態圈。

    免責聲明:市場有風險,選擇需謹慎!此文僅供參考,不作買賣依據。

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