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    環(huán)球視點(diǎn)!cDNA和基因組DNA的區(qū)別

    2023-04-25 10:12:08來源:?jiǎn)袅▎袅?nbsp; 

    什么是cDNA

    cDNA(互補(bǔ)DNA)是指其堿基序列與DNA互補(bǔ)的合成DNA。它是由RNA模板的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的??俁NA,前mRNA,RNA,核糖體RNA或tRNA可用于逆轉(zhuǎn)錄。逆轉(zhuǎn)錄酶是催化從RNA產(chǎn)生cDNA的反應(yīng)的酶。逆轉(zhuǎn)錄與PCR耦合如圖1所示。


    (資料圖)

    圖1.逆轉(zhuǎn)錄與PCR耦合

    cDNA主要用于克隆原核基因組中的真核基因。外顯子由蛋白質(zhì)的編碼區(qū)組成。在真核生物中,編碼區(qū)被內(nèi)含子中斷。在轉(zhuǎn)錄過程中,內(nèi)含子和外顯子都被編碼到前mRNA中。但是在mRNA加工過程中,內(nèi)含子從mRNA中去除,通過將外顯子剪接在一起產(chǎn)生成熟的mRNA。生物體的總mRNA稱為轉(zhuǎn)錄組。然而,原核生物缺乏mRNA加工機(jī)制。因此,mRNA用于合成僅包含基因組蛋白質(zhì)編碼區(qū)域的cDNA。這種cDNA用于將基因克隆成原核生物。cDNA在逆轉(zhuǎn)錄病毒中在RNA基因組轉(zhuǎn)化為DNA的過程中自然產(chǎn)生。

    什么是基因組基因

    基因組DNA(gDNA)是指基因組中染色體DNA的集合。特定生物體的全部基因集被稱為其基因組。然而,不僅基因組的基因是活躍的。大多數(shù)生物群在群體內(nèi)具有相似類型的基因組DNA。生物體的基因組從下一代傳給另一代。通常,基因組由大量堿基對(duì)組成。例如,人類基因組由大約30億個(gè)堿基對(duì)組成。人類基因組的染色體如圖2所示。

    圖2.人類基因組的染色體

    在基因組DNA中發(fā)現(xiàn)的四種類型的序列是蛋白質(zhì)編碼基因,串聯(lián)重復(fù)基因,重復(fù)DNA和間隔DNA?;蚪MDNA用于分子生物學(xué)的許多實(shí)驗(yàn)。與cDNA的制備相比,基因組DNA的分離很容易。基因組 DNA 可用作 PCR 模板,用于克隆、測(cè)序、制備基因組文庫、DNA 指紋圖譜、研究基因結(jié)構(gòu)和檢測(cè)突變/異常。

    cDNA和基因組DNA的區(qū)別

    定義

    cDNA:cDNA是合成DNA,其堿基序列與基因組DNA互補(bǔ)。

    基因組DNA:基因組DNA是基因組中染色體DNA的全套。

    代表

    cDNA:cDNA代表轉(zhuǎn)錄組。

    基因組DNA:DNA代表基因組。

    合成/提取自

    cDNA:cDNA是由不同類型RNA的逆轉(zhuǎn)錄合成的。

    基因組DNA:基因組DNA可以從現(xiàn)有基因組中提取。

    內(nèi)容

    cDNA:cDNA由外顯子或編碼區(qū)組成。

    基因組DNA:基因組DNA由生物體的編碼和非編碼序列組成。

    數(shù)量

    cDNA:cDNA包含一些堿基對(duì)。

    基因組DNA:基因組DNA包含大量堿基對(duì)。

    應(yīng)用

    cDNA:cDNA用于產(chǎn)生cDNA文庫。

    基因組DNA:基因組DNA可用于產(chǎn)生基因組文庫。

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